peršvietimo elektroniniu mikroskopu gautas naujojo 2019 koronaviruso (SŪRS‑CoV‑2, arba SARS‑CoV‑2, 2019‑nCoV), išskirto iš sergančiojo COVID-19, vaizdas. Viruso dalelės iškyla iš laboratorijoje auginamų ląstelių paviršiaus

naujojo 2019 koronaviruso molekulinis modelis

žmogaũs koronavrusai, Coronaviridea šeimos, Orthocoronovirinae pošeimio virusai, sukeliantys žmogaus infekcines ligas. Daugiausia sukelia vadinamąsias peršalimo ligas, kurių simptomai – karščiavimas, gerklės skausmas, kosulys. Jie t. p. gali sukelti bronchitą ir plaučių uždegimą. Šiuo metu žinomi 7 žmogaus koronavirusai: žmogaus koronavirusas 229E, žmogaus koronavirusas OC43, žmogaus koronavirusas NL63, žmogaus koronavirusas HKU1, SŪRS (angl. SARS) koronavirusas, ARRS (angl. MERS) koronavirusas, naujasis 2019 koronavirusas.

Žmogaus koronavirusai 229E, NL63, OC43 ir HKU1 nuolat cirkuliuoja populiacijoje ir sukelia palyginti nesunkias viršutinių kvėpavimo takų infekcijas suaugusiesiems ir vaikams, ypač žiemą ir ankstyvą pavasarį. SŪRS, ARRS koronavirusai ir naujasis 2019 koronavirusas yra pavojingesni, jų protrūkiai nusinešė nemažai žmonių gyvybių.

SŪRS koronavirusas

SŪRS (sunkaus ūmaus respiracinio sindromo), arba SARS (angl. Severe acute respiratory syndrome), koronavirusinės infekcijos protrūkis prasidėjo 2002 lapkritį Pietų Kinijoje ir truko iki 2003 birželio. Iš viso buvo užregistruoti 8098 SŪRS atvejai 17 šalių, daugiausia Kinijoje ir Honkonge. Mirtingumas nuo SŪRS siekė 9,6 % – mirė iš viso 774 susirgusieji. 2003 balandį buvo iššifruotas pilnas 29,7 kilobazių ilgio SŪRS koronaviruso genomas. Genome yra 13 genų, kurie koduoja 14 viruso baltymų. Tai koronavirusams būdingi baltymai (replikazė, proteazė, S, M, E ir N baltymai) ir dar 8 pagalbiniai baltymai, kurių funkcijos nežinomos. 2017 įrodyta SŪRS viruso zoonotinė kilmė – virusas buvo aptiktas civetose (Paguma sp.), t. p. panašūs į SŪRS virusai buvo aptikti Kinijos šikšnosparniuose. Infekuoti gyvūnai neturėjo jokių ligos požymių. Šių koronavirusų filogenetinė analizė parodė, kad SŪRS koronavirusas yra kilęs iš šikšnosparnių, o žmonės juo užsikrėtė Kinijos turguose arba tiesiai nuo šikšnosparnių, arba per kitus šį virusą nešiojančius gyvūnus.

SŪRS simptomai primena gripą – tai karščiavimas (kūno temperatūra pakyla daugiau kaip 38 °C), raumenų, gerklės skausmai, kosulys. Ligai progresuojant gali vystytis plaučių uždegimas ir kvėpavimo nepakankamumas. SŪRS virusas perduodamas oro lašiniu būdu ir pirmiausia infekuoja kvėpavimo takų gleivinę. Nors kai kuriems ligoniams SŪRS gali pasireikšti ir viduriavimu, nėra įrodymų, kad virusas plistų per išmatas. SŪRS viruso infekcijos inkubacinis periodas yra vidutiniškai 4–6 d., jis gali svyruoti nuo 1 iki 14 dienų.

SŪRS protrūkį pavyko suvaldyti – nuo 2004 šios ligos atvejų pasaulyje neužregistruota.

ARRS koronavirusas

ARRS (Artimųjų Rytų respiracinio sindromo), arba MERS (angl. Middle East respiratory syndrome), koronavirusinės infekcijos protrūkis prasidėjo 2012 rugsėjį Saudo Arabijoje, iki 2013 spalio ten buvo užregistruota 124 ARRS atvejų, 52 susirgusieji mirė. Iki 2019 gruodžio pasaulyje užregistruoti 2468 ARRS koronaviruso infekcijos atvejai, iš kurių 851 baigėsi mirtimi. Mirtingumas nuo ARRS siekia 34,5 %. Daugiausia ARRS atvejų buvo užregistruota Saudo Arabijoje, Pietų Korėjoje, Jungtiniuose Arabų Emyratuose, Jordanijoje, Katare. Dar 19 šalių buvo užregistruoti pavieniai ARRS atvejai. 2012 lapkritį paskelbti duomenys apie ARRS koronaviruso genomą – jį sudaro S, E, M, N genai ir keletas nestruktūrinių baltymų genų. ARRS koronavirusas sunkiai perduodamas žmogaus žmogui, todėl jo plitimas ribotas. Manoma, ARRS koronavirusas yra kilęs iš šikšnosparnių, o žmonės juo užsikrėtė per kitus nešiotojus, tokius kaip kupranugariai (jų kraujuje buvo nustatyti neutralizuojantys antikūnai prieš ARRS koronavirusą, o nosiaryklės tepinėliuose aptiktos šiam virusui būdingos genų sekos). ARRS koronaviruso užkratas žmonėms galėjo patekti per kupranugarių šlapimą, kuris Vidurio Rytuose iki šiol dažnai vartojamas kaip liaudies medicinos priemonė įvairioms ligoms gydyti.

ARRS simptomai – karščiavimas, raumenų, gerklės, pilvo skausmai, vėmimas, viduriavimas. Ligai progresuojant gali vystytis plaučių uždegimas, kvėpavimo nepakankamumas, inkstų nepakankamumas, kraujo krešėjimo sutrikimai, perikarditas. ARRS viruso infekcijos inkubacinis periodas yra vidutiniškai 5,5 d., jis gali svyruoti nuo 1,9 iki 14,7 dienų.

Naujasis 2019 koronavirusas

Naujojo 2019 koronaviruso (liet. SŪRS‑CoV‑2, angl. SARS‑CoV‑2, 2019‑nCoV) infekcijos, arba COVID‑19 (angl. Coronavirus Disease 2019), protrūkis prasidėjo Kinijos mieste Uhane, kuris yra septintasis pagal dydį Kinijos miestas (11 mln. gyventojų). 2019 gruodį šiame mieste buvo užregistruoti nežinomos kilmės plaučių uždegimo atvejai, jie buvo susieti su užkratu iš Huanano jūros gėrybių turgaus. 2020 01 12 buvo iššifruotas šio koronaviruso genomas, kuris yra 30 kilobazių ilgio ir 79,5 % sutampa su SARS koronaviruso genomu, apie 50 % – su MERS ir 96 % – su šikšnosparnių koronavirusų genomu. Remiantis šiais rezultatais, manoma, kad naujasis koronavirusas žmonėms pateko iš šikšnosparnių. Atlikus naujojo koronaviruso baltymų modeliavimo eksperimentus, nustatyta, kad viruso S baltymas specifiškai jungiasi su ACE2 baltymu ląstelėse. Tai rodo, kad ACE2 yra šio viruso receptorius, kuris padeda virusui patekti į ląstelę.

Šis koronavirusas gali sukelti tiek lengvą, tiek sunkią infekcinę ligą, kurios simptomai – karščiavimas, kosulys, viduriavimas, plaučių uždegimas, kvėpavimo nepakankamumas, inkstų nepakankamumas. Virusas perduodamas oro lašiniu būdu, ant plastiko, nerūdijančio plieno paviršiaus pavojingas išlieka iki 3 parų, ant medinių paviršių – iki 4 valandų.

Naujojo 2019 koronaviruso infekcijos diagnostikai naudojamas molekulinis metodas – tikro laiko polimerazės grandininė reakcija (rt‑PCR). Šiuo metodu nustatomos tam tikros koronaviruso RNR sekos, kurios buvo parinktos iššifravus viruso genomą. Naudojant šį metodą koronavirusą galima aptikti kraujo mėginiuose arba nosiaryklės tepinėliuose (mėginius galima saugoti iki 3 parų 4 °C temperatūroje).

Pasaulio sveikatos organizacija 2020 01 30 dėl naujojo koronaviruso protrūkio paskelbė pasaulinę ypatingąją padėtį, 2020 03 11 – naujojo koronaviruso sukeltą pandemiją.

Lietuvoje, siekiant suvaldyti koronaviruso grėsmes, Vyriausybė 2020 02 26 paskelbė valstybės lygio ekstremalią situaciją, 2020 03 16 – karantiną šalies mastu. Karantinas atšauktas 2020 06 17.

COVID‑19 pandemija

Iki 2020 02 04 užregistruota 20 604 infekcijos atvejai, iš jų 20 416 atvejų – Kinijoje; apie penktadalis infekcijos atvejų buvo sunkūs. Mirtingumas nuo šios infekcijos 2–3 %. Iki 2020 02 03 užregistruota 427 mirties atvejų.

Iki 2020 03 19 užregistruota 219 385 infekcijos atvejai 176 šalyse, iš jų 80 928 – Kinijoje, 35 713 – Italijoje, 17 361 – Irane, 14 769 – Ispanijoje, 12 327 – Vokietijoje, 9464 – Jungtinėse Amerikos Valstijose (JAV), 9134 – Prancūzijoje, 8565 – Pietų Korėjoje, 3115 – Šveicarijoje, 2626 – Didžiojoje Britanijoje, 2051 – Olandijoje, 1646 – Austrijoje, 1591 – Norvegijoje, 1486 – Belgijoje, 1301 – Švedijoje, 1057 – Danijoje; 34 atvejai Lietuvoje (1 ligonė pasveiko); apie penktadalį infekcijos atvejų buvo sunkūs. Iki 2020 03 19 užregistruota 8970 mirties atvejų, 85 749 ligoniai pasveiko.

Iki 2020 04 02 10 val. užregistruota 937 100 infekcijos atvejų 203 šalyse, iš jų 215 344 – JAV, 110 574 – Italijoje, 104 118 – Ispanijoje, 81 554 – Kinijoje, 77 981 – Vokietijoje, 56 989 – Prancūzijoje, 47 593 – Irane, 29 474 – Didžiojoje Britanijoje, 17 768 – Šveicarijoje, 15 679 – Turkijoje, 13 964 – Belgijoje, 13 614 – Olandijoje; 649 atvejai Lietuvoje (7 ligoniai pasveiko, 8 mirė). Iki 2020 04 02 10 val. užregistruota 47 264 mirties atvejai, 194 666 ligoniai pasveiko.

Iki 2020 04 14 14 val. užregistruota 1 934 986 infekcijos atvejai 210 šalių, iš jų 587 173 – JAV, 172 541 – Ispanijoje, 159 516 – Italijoje, 136 779 – Prancūzijoje, 130 072 – Vokietijoje, 88 621 – Didžiojoje Britanijoje, 82 249 – Kinijoje, 73 303 – Irane, 61 049 – Turkijoje, 31 119 – Belgijoje, 26 551 – Olandijoje, 25 688 – Šveicarijoje; 1070 atvejų Lietuvoje (101 ligonis pasveiko, 25 mirė). Iki 2020 04 14 14 val. užregistruota 120 438 mirties atvejai, 456 841 ligonis pasveiko.

Iki 2020 04 30 15 val. užregistruota 3 239 220 infekcijos atvejų 211 šalių, iš jų 1 064 819 – JAV, 236 899 – Ispanijoje, 203 591 – Italijoje, 166 420 – Prancūzijoje, 165 221 – Didžiojoje Britanijoje, 161 552 – Vokietijoje, 117 589 – Turkijoje, 106 498 – Rusijoje, 94 640 – Irane, 82 862 – Kinijoje, 79 685 – Brazilijoje, 51 597 – Kanadoje, 48 519 – Belgijoje; 1385 atvejai Lietuvoje (589 ligoniai pasveiko, 45 mirė). Iki 2020 04 30 15 val. užregistruota 228 860 mirties atvejų, 1 010 659 ligoniai pasveiko.

Iki 2020 06 17 9 val. užregistruota 8 265 174 infekcijos atvejai 213 šalių, iš jų 2 208 400 – JAV, 928 834 – Brazilijoje, 545 458 – Rusijoje, 354 161 – Indijoje, 298 136 – Didžiojoje Britanijoje, 291 408 – Ispanijoje, 237 500 – Italijoje, 237 156 – Peru, 192 439 – Irane, 188 382 – Vokietijoje, 184 449 – Čilėje, 181 298 – Turkijoje, 157 716 – Prancūzijoje, 154 863 – Meksikoje, 154 760 – Pakistane, 136 315 – Saudo Arabijoje, 99 467 – Kanadoje, 94 481 – Bangladeše, 83 265 – Kinijoje; 1776 atvejai Lietuvoje (1441 ligonis pasveiko, 76 mirė). Iki 2020 06 17 9 val. užregistruota 446 149 mirties atvejai, 4 322 658 ligoniai pasveiko.

Iki 2020 09 25 12 val. užregistruota 32 440 353 infekcijos atvejai 213 šalių, iš jų 7 185 516 – JAV, 5 818 570 – Indijoje, 4 659 909 – Brazilijoje, 1 136 048 – Rusijoje, 790 823 – Kolumbijoje, 788 930 – Peru, 715 457 – Meksikoje, 704 209 – Ispanijoje, 678 266 – Argentinoje, 667 049 – Pietų Afrikoje, 497 237 – Prancūzijoje; 4184 atvejai Lietuvoje (2298 ligoniai pasveiko, 89 mirė). Iki 2020 09 25 12 val. užregistruota 988 175 mirties atvejai, 23 946 081 ligonis pasveiko.

Iki 2020 10 20 10 val. užregistruota 40 662 611 infekcijos atvejų 215 šalių, iš jų 8 456 653 – JAV, 7 597 063 – Indijoje, 5 251 127 – Brazilijoje, 1 415 316 – Rusijoje, 1 015 795 – Ispanijoje, 1 002 662 – Argentinoje, 965 883 – Kolumbijoje, 910 277 – Prancūzijoje, 870 876 – Peru, 854 926 – Meksikoje, 741 212 – Didžiojoje Britanijoje, 705 254 – Pietų Afrikoje; 7928 atvejai Lietuvoje (3276 ligoniai pasveiko, 118 mirė). Iki 2020 10 20 10 val. užregistruota 1 123 195 mirties atvejai, 30 362 741 ligonis pasveiko.

Lietuvoje sergamumo pirmas pikas pasiektas 2020 04 20 (1047 sergantieji), nuo tada sergančiųjų skaičius mažėjo (2020 06 17 atšaukus karantiną jų buvo 259). 2020 07 04 fiksuotas mažiausias sergančiųjų skaičius – 207. Nuo liepos vidurio užsikrėtusiųjų pradėjo daugėti, 2020 10 22 nustatyta daugiausia (442) naujų COVID‑19 atvejų, 2020 10 22 sergančiųjų buvo 5000.

774

-koronavirusas; -koronavirusai; -virusai; -COVID‑19; -SŪRS; -SARS; -ARRS; -MERS; -naujasis 2019 koronavirusas; -koronovirusas; -SŪRS‑CoV‑2; -SARS‑CoV‑2; -2019‑nCoV; -koronaviruso; -coronavirusas

koronavirusai

gyvūnų koronavirusai